Santos, som i november knep en stol i representanthuset, utreds av FBI och åklagare i New York. Bland annat finns misstankar om oegentligheter gällande hans kampanjfinansiering. Han anklagas även för en rad lögner, bland annat om sin yrkesmässiga bakgrund och sin utbildningsnivå.
Han väntas framträda i domstol redan på onsdagen, men då sekretess råder är inga detaljer kring åtalet ännu offentliggjorda.
Santos har redan utretts av flera parter, bland annat representanthusets etiska råd, rapporterar CNN.
Toppdemokrater, tillsammans med några republikaner i New York, har uppmanat Santos att avgå.
Representanthusets talman Kevin McCarthy (R) säger till CNN att han vill se åtalspunkterna innan han avgör om han tycker att Santos bör lämna kongressen.
"Jag ska titta på anklagelserna", sa republikanen i Kalifornien till CNN på tisdagen.
Förutom påståenden om brott mot kampanjfinansieringslagar, finns uppgifter om att Santos bland annat ska ha brutit mot lagar gällande intressekonflikter och förskingrat pengar.
Santos har erkänt några vilseledande påståenden om sin utbildning och ekonomiska situation men nekar till de allvarligare anklagelserna.