Enligt New Yorks brandkår kom larmet om att en brand brutit ut i färjans maskinrum klockan fem på eftermiddagen lokal tid, enligt WNBC-TV.
Fem personer ska ha skadats i branden och tre av dem fördes till sjukhus för vård.
Den amerikanska kustbevakningen skötte evakueringen av passagerarna som transporterades till färjeterminalen på Staten Island. Evakueringen uppges ha tagit mindre än en timme.