Intrånget har upptäckts hos 25 företag, varav flera statliga myndigheter, skriver Microsoft i ett blogginlägg.
USA:s nationella säkerhetsrådgivare Jake Sullivan uppger att intrånget upptäcktes "ganska snabbt".
– Vi kunde förhindra ytterligare intrång, sade han i en intervju med amerikanska ABC på onsdagen.
Det är oklart vilka myndigheter som utsatts. Men USA:s utrikesdepartement har upptäckt "onormal aktivitet" och vidtagit "omedelbara åtgärder för att säkra våra system", uppger en talesperson för myndigheten enligt AFP.
Hackergruppen, som Microsoft kallar för Storm-0558, har sin bas i Kina. Gruppen riktar sig i första hand mot statliga myndigheter i Västeuropa och fokuserar på spionage och datastöld, enligt Microsoft.
Handelsminister Gina Raimondo, som retat Kina genom att införa hårda exportkontroller, finns bland de hackade kontona, rapporterar Washington Post med hänvisning till en myndighetskälla.
Intrånget ska ha upptäckts i mitten av juni och FBI utreder händelsen, skriver tidningen.