Åtgärderna vidtas efter att personer som The Wall Street Journals Rysslandskorrespondent Evan Gershkovich tagits som "gisslan".
Journalisten greps i Ryssland i slutet av mars.
Både FSB och revolutionsgardet är sedan tidigare mål för amerikanska straffåtgärder.
"Användningen av människor som politiska spelpjäser, som förhandlingsobjekt, fängslade av regeringar men på falska premisser, är en praxis som verkar gå i fel riktning", enligt ett uttalande av departementet.
Syftet med sanktionerna är bland annat avskräckning.
Minst tre amerikanska medborgare hålls fängslade i iranska fängelser, inklusive affärsmannen Siamak Namazi, som suttit fängslad sedan 2015.