Andaya sade att han lämnar posten på grund av hälsoskäl. Han har dock fått mycket kritik då han under bränderna inte använde de varningssirener som finns på öarna för att varna om naturkatastrofer. Ett beslut som han hittills har försvarat.
På onsdagen förklarade han att man var rädd att människor skulle röra sig in mot land och upp i bergen om man man hade använt sirenerna.
– I så fall hade de gått rakt mot elden, sade Andaya.
Minst 111 personer omkom i bränderna.
Myndigheternas agerande kommer att utredas, säger delstaten Hawaiis chefsåklagare Anne Lopez.