Mannen påstås ha varit känd för att syssla med vapensmuggling, och att hjälpa IS-krigare.
Enligt USA skadades ytterligare en person, och två personer frihetsberövades. Syrisk stats-tv uppger att flera helikoptrar har varit inblandade i insatsen som skedde innan gryningen på torsdagen.
Ett vittne som bor i den by där räden genomfördes bekräftar att de amerikanska soldaterna flög in i tre helikoptrar.
– De använde högtalare där de uppmanade de boende att stanna inomhus, säger bybon till AFP.
Enligt brittiskbaserade oppositionella SOHR är det första gången som USA genomfört en liknande insats i ett område som kontrolleras av syriska regimen sedan kriget inleddes 2011.
USA följde upp räden med ett flyganfall i norra Syrien på torsdagskvällen, där två högt uppsatta IS-medlemmar dödades.