Austin gjorde ett test efter att ha känt av milda symptom i hemmet, meddelar han på Twitter.
Försvarsministern kommer att isolera sig hemma de närmaste fem dagarna och, när det är möjligt, delta i möten digitalt. Austin är fullvaccinerad och fick sin tredje dos i oktober. Tack vare vaccinen är hans infektion betydligt mildare än vad den annars hade varit, skriver han med hänvisning till sin läkare.
"Vaccin fungerar och kommer att fortsätta att vara ett medicinskt krav för våra anställda inom militären", skriver han.
Sist Austin träffade president Joe Biden var den 21 december, en vecka innan symptomen började och samma dag som han gjorde ett negativt covidtest, uppger han.