Processen är unik såtillvida att det är första gången ett brottmål om sexuella övergrepp begångna i den påvliga mikrostaten prövas rättsligt.
Den huvudåtalade, en präst som nu är i övre 20-årsåldern, frias från anklagelser om att ha förgripit sig på en yngre pojke då de båda var korgossar, mellan 2007 och 2012. Ytterligare en präst stod åtalad för att ha skyddat den misstänkte förövaren.
Beskedet kommer dagen efter en rapport från en oberoende kommission i Frankrike, som slår fast att präster, diakoner och andra kopplade till katolska kyrkan i landet har förgripit sig på 300 000 barn sedan 1950-talet.