Orsaken är att forskaren misstänks ha gjort sig skyldig till sexuella trakasserier.
Den danske forskaren, som ansvarade för WHO:s del i den forskardelegation som FN sände till Kina för två år sedan, och hans team arbetade nära kinesiska forskare för att ta reda på hur viruset började smitta människor.
Forskaren avskedades redan i fjol, men det är först nu som WHO bekräftar det hela, rapporterar AP.