Nyligen bestämdes att allmänna val snart ska hållas i landet i södra Afrika och läget är spänt inför valet i augusti.
Zanu-PF har haft makten i Zimbabwe sedan 1980.
Enligt åklagarsidan attackerade de 39 regeringspartiet Zanu-PF:s kontor i orten Nyatsime, söder om huvudstaden Harare, i förra veckan.
De anklagade "förstörde flera hus, misshandlade boende i Nyatsime och orsakade därigenom massiv förstörelse av egendom och tillfogade allvarliga skador", påstår åklagarna.
Men deras advokater hävdar att gripandena och rättsprocessen är helt och hållet politiskt motiverad.
– Våra klienter var inte ens på platsen, säger Anesu Chirisa, juridisk chef vid Zimbabwe Human Rights Forum, en paraplyorganisation som representerar de anklagade.
De 39 är alla anhängare av oppositionspartiet CCC.
CCC:s ledare Nelson Chamisa, är en 45-årig advokat och pastor, som hoppas ersätta den 80-åriga presidenten Emmerson Mnangagwa, som söker en andra mandatperiod.
Kritiker har anklagat regeringen för att använda domstolarna för att särskilt rikta in sig på oppositionspolitiker.
Tidigare i juni greps fem CCC-anhängare och anklagades bland annat för misshandel efter ett påstått bråk vid ett valregistreringscenter.