Det hände vid 9.30-tiden och tåget var på väg norrut från Kalmar till Linköping.
– Det var inte så att tåget spårade ur, det kunde fortsätta, berättar Ulf Gollungberg på Vimmerbypolisen, men det skulle ju kunnat gå värre och stenen kunde ha träffat någon.
Brottsanmälan gäller framkallande av fara för annan.