Gian Piero Gasperini var på plats vid sidlinjen den 10 mars när de båda lagen möttes.
– Jag var rädd. Dagen före matchen var jag sjuk och samma eftermiddag kände jag mig sämre. Jag sov dåligt de kommande två nätterna, säger han till den italienska tidningen La Gazzetta dello Sport.
Efter matchen isolerade Gasperini sig i tre veckor på Atalantas träningsanläggning. Ett senare antikroppstest bekräftade att han hade varit smittad med det nya coronaviruset.
Matchen, som var ett returmöte, spelades utan publik. Valencia säger i ett uttalande att man är förvånad över att Gasperini inte vidtog förebyggande åtgärder.
"Sådant agerande, om så var fallet, skulle ha utsatt flertalet personer för risk under resan till – och vistelsen i – Valencia", skriver den spanska klubben.
Det första mötet mellan klubbarna sågs av 40 000 besökare i San Siro i Milano, vilket tros ha lett till att många smittades i Spanien och Italien. Staden Bergamos borgmästare Giorgio Gori beskrev senare den matchen som en biologisk bomb.
Atalanta vann dubbelmötet mot Valencia med totalt 8–4. En vecka efter sista mötet meddelade Valencia att en dryg tredjedel av truppen och personalen hade testat positivt för det nya coronaviruset.