Den misstänkte, en 19-årig man, greps på tisdagskvällen sedan han gjort en Hitlerhälsning framför 16 israeliska idrottare som besökte ett minnesmärke över massakern vid OS i München 1972, meddelar tysk polis.
”En av de fyra närvarande säkerhetsvakterna observerades omkring klockan 19.20 göra en nationalsocialistisk hälsning", skriver polisen i uttalandet.
Enligt polisen misstänks 19-åringens tre kollegor i nuläget inte för brott. EM-arrangörerna har dock portat dem från resterande evenemang under mästerskapet.
Idrottarna själva hade inte märkt gesten, som är förbjuden i Tyskland och kan ge upp till sex månaders fängelse.
Enligt tidningen Süddeutsche Zeitung är 19-åringen inte känd av polisen sedan tidigare.
Känslig tidpunkt
Gripandet skedde vid en känslig tidpunkt, då München arrangerar Europamästerskapen 50 år efter massakern vid OS 1972. Då mördades 11 israeliska idrottare.
Åtta palestinier, medlemmar i terroristgruppen Svarta september, tog sig in i OS-byn i München och dödade först två israeliska idrottsmän och tog därefter nio israeler som gisslan. Spelen avbröts därefter tillfälligt.
Terrorgruppen krävde att den israeliska staten skulle släppa 234 palestinska fångar skulle släppas.
Slutade med tragedi
Israel vägrade och västtysk polis och tyska myndigheter inledde en räddningsaktion. Den slutade dock i tragedi.
Svarta september avrättade samtliga i gisslan. Även fem, av åtta, medlemmar i Svarta september dödades liksom en västtysk polis.