En spelare testades positiv för viruset under lördagsförmiddagen.
"Spelaren är satt i karantän och övriga spelare och ledare har under lördagsförmiddagen testats negativt", skriver klubben i ett pressmeddelande.
Klubben har inte kommunicerat vem spelaren är som har smittats.
Malmö FF har tidigare drabbats av coronaviruset. Efter att laget säkrat SM-guldet i november i fjol testades lagkaptenen Anders Christiansen positivt för viruset, vilket tvingade klubben att ställa in det planerade guldfirandet.
Malmö FF vann den allsvenska premiären mot Hammarby förra helgen med 3–2.