En undersökning hemma i Finland visade att hon brutit vadbenet under masstarten i lördags där hon blev bästa finländska på tolfte plats.
– Kerttu märkte ingenting speciellt under tävlingen. Hon fick bara väldigt ont i benet, säger Finlands chefstränare Teemu Pasanen till Hufvudstadsbladet.
Banprofilen i masstarten kritiserades av många och under herrloppet kraschade flera åkare. Men Niskanen var inte med om någon incident.
– Vi märkte ingenting och hon ropade inget till oss. Det var först hemma i Finland som det klarnade att det var en fraktur. Jag har åtminstone aldrig sett något liknande förut, säger Pasanen.
Niskanen har varit bästa finländska i världscupen den här säsongen och en nyckel i stafettlaget. I stället för VM är nu säsongen över för henne.