33-åringen meddelar beslutet på Facebook.
"Det är inget enkelt beslut att ta efter så lång tid. Jag har dock länge känt att det vore idealiskt att avsluta karriären efter den här säsongen", skriver han.
Peiffer tävlade allra senaste i tjeckiska Nove Mesto, där han bland annat var en del av Tysklands mixedstafettlag som slutade nia. Tysken tog ett individuellt VM-silver så sent som i februari då han blev tvåa på herrarnas distanslopp över 20 kilometer.