Amerikanskan avbröt lagfinalen i mångkamp efter endast ett hopp. Och hon avstod från att ställa upp i mångkampsfinalen för att fokusera på sitt eget psykiska välmående. Hon sade då att hon upplevt stor mental press.
Och inför grenfinalerna, som startar på söndag, berättar Biles att hon har drabbats av gymnastikfenomenet "twisties".
– Jag vet allvarligt talat inte hur jag ska snurra, säger hon under en pressträff, uppger BBC.
Den fyrfaldiga OS-vinnaren, och en av de största stjärnorna inför Tokyo-spelen, har lagt ut på bilder på Instagram från sin träning där hon misslyckades med landningarna i barr.
Hon säger också att hon haft "twisties" förut, men aldrig tidigare i alla fyra grenarna. "Twisties" är ett fenomen i hopp och snurrar då kroppen vägrar att samarbeta så hjärnan tappar var gymnasten befinner sig i luften.
– Det har aldrig tidigare hänt i barr och bom, bara i hopp och fristående... de svåraste. Men nu finns det bokstavligen i alla grenar. Det suger... väldigt mycket, säger Biles.
Hon säger att det oftast tar mer än två veckor att komma över problemet.