Nederländaren, som har VM-guld på meritlistan och kom tvåa i Tokyo-OS för en tid sedan, bröt ett ben i högra handleden vid olyckan och opererades under fredagen.
"Det är en stor besvikelse för att jag är tillbaka i bra form igen. Jag kände mig väldigt stark under träningen och kände att jag hade en väldigt bra månad framför mig", säger Dumoulin i ett uttalande från stallet Jumbo-Visma.
Dumoulin tog i fjol ett fem månader långt uppehåll på grund av psykisk ohälsa.
VM i cykel går i Belgien mellan den 19 och 26 september.