Friplatsen till OS bekräftas av Internationella olympiska kommitténs (IOK) ordförande Thomas Bach.
"Vi gör ett unikt undantag", skriver han i ett brev till ukrainskan.
Charlan, som vann matchen mot Smirnova med 15–7 innan hon diskades och därmed var borta från VM, kan nu se sin OS-plats som säkrad.
Detta sedan Thomas Bach meddelat att Charlan kommer erbjudas en extraplats till Paris om hon inte skulle lyckas kvala in.
Under onsdagen kom beskedet att Ukraina ändrat sin tidigare policy att inte låta sina idrottare möta ryssar eller belarusier på grund av den pågående invasionen av landet.
Den nya policyn tillåter dem att möta ryssar och belarusier som tävlar under neutral flagg, vilket Smirnova gjorde.
Efteråt sträckte Charlan fram sin sabel snarare än sin hand och blev därefter diskvalificerad.
Efter beslutet rasade hon mot Internationella fäktningsförbundet (FIE).
– Det här förbundet (FIE) kommer aldrig att förändras. Inte under min livstid i alla fall, sade hon.
Det ukrainska fäktförbundet skickade in en protest mot diskvalificeringen av Charlan.
Protesten tycks fått gehör då ukrainskans diskning nu upphävts.
Charlan hyllas av Thomas Bach i ett personligt brev till henne.
"Det är beundransvärt hur du hanterat denna otroligt svåra situation. Det måste ha varit en berg-och-dalbana av känslor", skriver IOK-ordföranden.