Duon har tidigare jobbat ihop i FC Rosengård i damallsvenskan.
Winqvist kommer senast från Mjällby i herrallsvenskan.
Arsenal är tvåa i Super League, tre poäng bakom stadsrivalen Chelsea, med en match mindre spelad.
Härnäst väntar toppmatch, mot just Chelsea, den 15 januari.
Jonas Eidevall och Patrick Winqvist kommer att jobba med landslagsstjärnorna Stina Blackstenius och Lina Hurtig.