Det har länge spekulerats om att kontraktet ska brytas efter att relationen mellan Bengtsson och tränaren Jon Dahl Tomasson brutit samman. Kontraktet går egentligen ut efter nästa säsong.
34-åringen var i frysboxen under hela fjolåret och fick endast sex minuters speltid i allsvenskan.
"Jag har fått uppleva många framgångar med SM-guld och Europaspel. De fem åren kommer jag att ta med mig även om ett år på slutet inte blev som jag hade tänkt.", säger Bengtsson i ett uttalande på klubbens hemsida.
Bengtsson är fostrad i Malmö och återkom till klubben 2015 efter spel i tyska Hertha Berlin och nederländska Twente. Han vann tre SM-guld med klubben (2016, 2017 och 2020), och har representerat laget i Europa League och Champions League.
Sammanlagt gjorde han 161 matcher för Malmö.
"Det är naturligtvis väldigt tråkigt att det har blivit så här. Samtidigt är det skönt att vi har kommit till ett avslut för situationen var inte gynnsam för varken oss eller Rasmus. Vi har hittat varandra i detta på ett bra sätt och är eniga i beslutet", säger Malmö FF:s vd Niclas Carlnén på klubbens hemsida.
Rättelse: i en tidigare version stod det Carlén, rätt namn är Carlnén.