Elanga spelade i söndagens Premier League-möte med West Ham där han gjorde mål i 2–3-förlusten.
Trots det har 21-åringen inte anslutit till Sveriges landslagssamling.
– Efter matchen fick han en känning. Det hände något under matchen. Jag pratade med honom i morse och det var tillräckligt illa för att han kände att han inte skulle kunna vara med och bidra den här veckan, säger förbundskapten Janne Andersson på en presskonferens.
Till matchen mot Azerbajdzjan i Baku åker inte heller försvarsduon Emil Holm och Ludwig Augustinsson med.
– Vi har en liten förhoppning om att de ska kunna ansluta på fredag, säger Andersson.
I stället har Isak Hien (Verona) och Niklas Hult (Elfsborg) kallats in.
– Niklas har varit med oss tidigare och varit precis i gränslandet hela tiden. Några spelare har gått före tidigare men nu är andra spelare skadade och då står Niklas på tur. Han är en jättebra ytterback.
Sedan tidigare har även yttern Jesper Karlsson tvingats lämna återbud.