Den uruguayanske Manchester United-stjärnan riskerar därmed flera matchers avstängning.
Det var efter matchen mot Southampton i slutet av november som Cavani tackade en supporter med en kommentar som uppfattades som rasistisk.
"Edinson och klubben var tydliga med att det absolut inte fanns något ont uppsåt bakom meddelandet, som han raderade och bad om ursäkt för så fort han informerades om att det kunde misstolkas", skriver United i ett uttalande.
Senast den 4 januari måste Cavani inkomma med ett svar på anklagelserna från FA.