I ett första uttalande från det internationella fotbollsförbundet Fifa skickar Gianni Infantino sina kondoleanser till drabbade.
"Fotbollsvärlden är i ett tillstånd av chock efter den tragiska incidenten", säger Infantino i ett pressmeddelande.
Lördagens möte mellan Arema FC och Persebaya Surabaya slutade i att delar av hemmalagets supportrar stormade planen. Polisen på plats svarade med att skjuta tårgas vilket skapade panik och rusningar på läktaren när många fick svårt att andas.
Ett stort antal människor miste livet i samband med kaoset, där oroligheterna även fortsatte utanför arenan.
"Det här är en mörk dag för alla som är inblandade i fotboll och en tragedi bortom förståelse", säger Infantino.
Efter tragedin har all ligafotboll i Indonesien tillfälligt stoppats. I maj nästa år står landet som värld för U20-VM i fotboll, och frågan är hur lördagens händelser påverkar arrangemanget för mästerskapet.
Landets ungdoms- och idrottsminister Zainudin Amali säger att händelsen har skadad bilden av landet, men att han ändå tror att man får fortsätta stå som värd.
– Förhoppningsvis kommer vi inte att bli sanktionerade av Fifa, säger Zainudin Amali enligt AP.