Martin Ericsson, som varit assisterande sportchef i år, tar över ansvaret för fotbollsverksamheten.
Ingen annan sportchef i allsvenskan har suttit längre på sin post än Karlsson. Och han har uppnått flera framgångar med klubben sedan starten 2008. Redan under det första året, då han också var tränare, tog sig laget upp i allsvenskan. Därefter har Häcken kommit tvåa i allsvenskan (2012), tagit två cupguld (2016 och 2019) och fått fira flera allsvenska skyttekungar under 2010-talet.
"Det vi satte oss att försöka göra, lyckades vi fasen genomföra och det är jag jädrigt stolt över. Att bygga föreningen stark och allsvensk i ett långsiktigt perspektiv", säger Karlsson till klubbens webbplats.
Han fortsätter i BK Häcken ett år till men då i rollen som sportslig rådgivare.