Benjamin Laudon stod för Västra Hargs avgörande mål på stopptid.
Första halvlek blev mållös och det dröjde till den 64:e minuten innan Noel Jänkälä Bladh gav Västra Harg ledningen.
I 69:e minuten nätade Adam Härnström, och kvitterade för Hägerstad.
Det matchavgörande målet kom på tilläggstid, när Benjamin Laudon slog till och gjorde 1-2 för Västra Harg.
Senaste mötet lagen emellan, 2017, slutade med seger för Hägerstad med 3-1.
Nästa motstånd för Hägerstad är Rimforsa. Lagen möts onsdag 23 april 19.00 på Rimaster Arena.