Farnerud tog över positionen i början av 2020 och trots värvningar som Marek Hamsik och Marcus Berg har resultaten lämnat mycket att önska för klubben.
Hans ansvarsområden ska nu delas upp i organisationen.
"Det handlar om att få fram maximalt av de personer och kompetenser vi har hos oss – så att IFK Göteborg når ännu fler framgångar. Fokus är på att skapa de bästa förutsättningarna för att lyckas. Nu ser vi över organisation i detalj och vi arbetar hela tiden med att stärka upp den för framtiden", säger klubbdirektören Håkan Mild i ett pressmeddelande.
Blåvitt spelar sin premiärmatch den 3 april hemma mot Värnamo.