Anmälan gäller ett ingripande vid Solna station i samband med fotbollsderbyt AIK–Djurgården på Friends arena i söndags.
I anmälan hänvisas till videoklipp där kravallutrustade poliser "använder pepparspray aggressivt mot hela gruppen av människor, i väldigt stor skala".
"Flera av poliserna i kravallutrustning har dessutom nackskydden uppfällda och döljer därmed sina identifikationsnummer på hjälmarna. Minst en av poliserna på plats ska även ha haft sitt nummer bortskrapat enligt vittnesuppgifter", står det vidare i anmälan.
Stämningen har varit infekterad mellan olika supportergrupper och polisen. Supportrar har på olika sätt demonstrerat mot myndighetens arbete i samband med idrottsarrangemang och den så kallade villkorstrappan. Enligt anmälan till justitieombudsmannen kan händelsen på Solna station "ses som en bestraffning för tidigare demonstration".
"Ingripandet av polisen i sin helhet vid pendeltågstationen saknar proportionalitet, en myndighet får inte använda mer ingripande åtgärder än vad som krävs med hänsyn till ändamålet", skriver man.