Karlsson togs ur tjänst i förra veckan sedan det visat sig att det rått brister i bokföringen i hans tidigare bolag. Nu har IFK Norrköpings ledning tagit beslutet att han inte kan vara kvar i föreningen.
– Styrelsen och "Munken" har tagit ett gemensamt beslut om att det är bäst för alla parter att han kliver åt sidan. Det beror på det som har kommit fram förra veckan och att vi sedan har tittat vidare på det här, säger klubbens ordförande Sakarias Mårdh till Norrköpings Tidningar.
Magnus Karlsson lämnade nyligen uppdragen som tränare och sportchef i Eskilstuna United i damallsvenskan för jobbet i IFK Norrköping.