President Alpha Conde har gripits i samband med kuppen, enligt ett uttalande i en video från kuppmakarna som skickats till nyhetsbyrån AFP.
I en annan video syns presidenten i en soffa omgiven av soldater.
Samtidigt uppger regeringen att en attack mot presidentpalatset har slagits tillbaka och att säkerhetsstyrkor återställer ordningen.
"Mycket viktigare"
Boenden i Conakry har vittnat om att de hört tung skottlossning tidigare under söndagen.
– Vi känner oss säkra. Men man vill helst att vi ska kunna åka härifrån, säger Aly Keita till Aftonbladet.
– Jag är här för att spela fotboll och hade hoppats få göra det i morgon här i Guinea. Det är synd. Men det viktigaste är att människorna mår bra. Det är mycket viktigare än fotboll, säger han.
VM-kvalmatchen mellan Guinea och Marocko skulle egentligen spelats under måndagen men har skjutits fram.
"Den politiska och säkerhetsmässiga situationen i Guinea är i nuläget ganska instabil och följs noga av Internationella fotbollsförbundet (Fifa) och afrikanska fotbollsförbundet (Caf)", skriver Fifa i ett uttalande.
Ska evakueras
Marockos landslag är fortsatt kvar på ett hotell en bit bort från händelserna, men man arbetar för att kunna evakuera laget under söndagen.
– Där finns redan ett flygplan redo på flygplatsen, säger Mohamed Makrouf på Marockos fotbollsförbund, enligt AFP.
I Marockos landslag spelar bland andra Paris Saint-Germain-backen Achraf Hakimi, Sevillas Youssef En-Nesyri och Benficas Adel Taarabt.
Liverpools mittfältare Naby Keita är Guineas stora stjärna. Dessutom spelar både Östersunds målvakt Aly Keita och den tidigare Malmö FF-spelaren Pa Konate i landslaget.