Han ersätts i truppen av försvararen Roman Jevgenjev.
Beskedet kommer dagen före Rysslands EM-premiär mot Belgien i S:t Petersburg.
"Vi måste vara noggranna med säkerheten. Låt oss hoppas att det här fallet blir det enda", säger Rysslands idrottsminister Oleg Matitsyn i ett uttalande enligt den statliga nyhetsbyrån Tass.
Ryssland är det senaste EM-laget som fått in konstaterad smitta i truppen. Tidigare har bland andra Nederländerna, Sverige och Spanien drabbats.