Operationen utfördes i lördags i São Paulo efter att brasilianen tidigare under veckan meddelat att han skulle besöka sjukhuset för rutinkontroller.
"Tumören identifierades under provtagningarna som jag nämnde i förra veckan", skriver Pelé på Instagram.
Tidigare under måndagen avdramatiserade managern Joe Fraga Pelés sjukhusbesök och hälsotillstånd i en intervju med tv-kanalen Globo, innan fotbollslegendaren själv skrev på Instagram.
Pelé är Brasiliens främste manlige målskytt genom tiderna med 77 mål på 92 landskamper. Under karriären var han bland annat med och tog tre VM-guld (1958, 1962 och 1970).