Southampton har polisanmält de "avskyvärda" meddelandena, uppger klubben.
Grova rasistiska påhopp och emojies föreställande apor fanns i meddelandet på Walker-Peters Instagramkonto.
I uttalandet skriver Premier League-klubben att man är "äcklad och besviken" på beteenden hos dem som hoppar på spelare för deras hudfärg. Klubben är även kritisk mot sociala medier "som tillåter att sådant hat sprids och får fäste".