Serbien utreds för olämpligt uppträdande mot spelare och domare, samt diskriminering.
Fifa slår inte fast när detta ska ha inträffat, men under matchen blev serbiska fans tillsagda att "sluta med diskriminerande ramsor och gester".
Det är inte helt klarlagt vad som föranledde meddelandet, men det kom kort efter en konfrontation mellan schweiziska lagkaptenen Granit Xhaka och flera serbiska spelare.
Ramsorna ska ha varit starkt anti-Kosovo, vars suveränitet inte erkänns av Serbien. Albanien-födde Xhaka har starka familjeband till Kosovo.
Upprörda avbytare från Serbiens bänk sprang in på planen efter att Xhaka tycktes gestikulera mot dem, innan domaren lyckades lugna ner situationen.
Kontroversiell flagga upprör
Serbien är redan föremål för en separat utredning från Fifa efter att landslaget hängde en kontroversiell flagga i sitt omklädningsrum.
Banderollen visade bilder på Kosovo som en del av Serbien och meddelandet "Vi ger oss aldrig". Kosovo anmälde därefter Serbien till Fifa.
Serbien slogs ut ur VM i gruppspelet.
Kastade omkull VAR-skärm
Även Uruguay är under utredning av Fifa. Detta efter 2–0-segern mot Ghana, vilken inte räckte för att Uruguay skulle gå till slutspel.
"La Celeste" behövde ytterligare ett mål för att sig vidare och tyckte att man rånades på två straffar.
Efteråt omringades domaren Daniel Siebert av arga uruguayanska spelare, inklusive José Giménez, Fernando Muslera, Edinson Cavani och Diego Godín. Anfallsstjärnan Cavani slog även omkull en VAR-skärm när han stormade av planen i avsky.
Kvartetten riskerar nu disciplinära åtgärder från Fifa. Det gör även det uruguayanska fotbollsförbundet för att ha misslyckats att kontrollera sina spelare.