– Jag var nöjd med att arbeta med det här laget, därför är jag ledsen över att lämna, säger den 70-årige schweizaren som tog över fotbollslandslaget 2018.
– Med tanke på våra mål har vi kommit överens om att avsluta vårt samarbete med vår tränare, säger Agim Ademi, ordförande för Kosovos fotbollsförbund.
Med fyra poäng på sju VM-kvalmatcher ligger Kosovo på femte och sista plats i grupp B utan chans till spel i slutspelet i Qatar nästa år. Det är oklart vem som leder laget i kvalavslutningen borta mot Grekland den 14 november.