Den förre fotbollsbasen dömdes till samma påföljd för två år sedan men efter ett överklagande fick rättegången tas om.
Nu är har de juridiska kvarnarna malt färdigt och Pelta får samma straff som för två år sedan.
Han får dessutom böta 2,5 miljoner kronor.
Åklagaren hade yrkat på tio år i fängelse för de brott Pelta anses ha gjort sig skyldig till, främst bedrägerier med offentliga medel under tiden som förbundsordförande. Samtidigt var Pelta verksam i FK Jablonec, en ligaklubb han delvis ägde.
Pelta avgick som förbundsordförande en månad efter skandalen som även fick en utbildningsminister att säga upp sig.