Övriga mål för bortalaget gjordes av Kevin Gaines och Daniel Malmström Arnesson, målen för Boxholm gjordes av Viktor Andersson och Victor Johansson.
Segern var Kisas femte på de senaste sex matcherna.
I halvtid var Boxholm alltså i ledningen med 2-1. Men Kisa vände - och vann.
Med två omgångar kvar är Boxholm på fjärde plats i tabellen, medan Kisa leder serien.
I nästa omgång har Kisa LSW hemma på Kisa IP, söndag 3 oktober 16.00.