Övriga mål för bortalaget gjordes av Emil Sjökvist och Erik Stejdahl, målet för Gunnebo gjordes av Ludvig Heinz.
Det var andra raka segern för HM IS, efter 3-2 mot Hultsfred i premiären.
I nästa omgång har HM IS Fårbo borta på Riavallen, Fårbo, lördag 30 april 16.00.