Uefa dömde från början Ungern till att spela tre matcher utan publik, men har nu ändrat domen till två matcher utan åskådare efter att det ungerska fotbollsförbundet överklagat domen.
Den andra matchen är dessutom villkorlig under två år.
Det ungerska förbundet får också böta 100 000 euro, runt en miljon kronor, och måste under ovan nämnda matcher ha en banderoll med texten "EqualGame" (jämlik sport) och Uefas logga.
Det var under sommarens EM-slutspel som ungerska supportrar anklagades för att ha skrikit homofobiska och rasistiska ramsor i matcherna mot Frankrike, Portugal och Tyskland.
Efter Uefas dom har även Fifa, det internationella fotbollsförbundet, straffat Ungern med tomma läktare i två matcher, den andra villkorlig i två år, och böter på motsvarande cirka två miljoner kronor, för rasistiska ramsor mot engelska spelare i en VM-kvalmatch i september.