I ett uttalande skriver touren att Monahan kliver åt sidan under obestämd tid för att "återhämta sig från sjukdom". Exakt vad det rör sig om går man inte in närmare på.
Vidare skriver man att hoppas att Monahans privatliv respekteras och att han har tourens fulla stöd.
I stället kommer vice vd-duon Ron Price och Tyler Dennis leda verksamheten framöver.
"Våra tankar är med Jay och hans familj under hans frånvaro och vi önskar honom ett snabbt tillfrisknande. Vi har ett starkt och erfaret ledarskap på plats och vår prioritet är att stötta spelarna och fortsätta arbetet med att leda PGA-touren in i golfens framtid", säger duon i ett gemensamt uttalande.
Det var i förra veckan som det blev klart att PGA-touren och DP World Tour (tidigare Europatouren) går samman med Saudiarabiens statliga investeringsfond Pif, som finansierar LIV-touren.
Beskedet ledde till massiv kritik mot Monahan. Inte minst från spelare då de inte hade informerats om sammanslagningen på förhand.
Monahan, som tidigare uttalat sig negativt kring Sauditouren, sade att han förstår kritiken.
– Jag är inte förvånad och förstår att folk kommer att kalla mig hycklare.