Stenson gick rundan på totalt 78 slag och ligger på en delad 135:e plats, åtta över par, inför fredagens spel.
Han ryckte visserligen upp sig med två birdies på hål 17 och 18, men fyra bogeys och tre dubbelbogeys på de övriga hålen gör att Stenson får kämpa ordentligt för att ta sig vidare till helgens avslutande rundor.
44-åringen, som fick en smäll på revbenen i en skidolycka tidigare i år, har haft det tungt och gick i förra veckan karriärens sämsta runda på PGA-touren med 85 slag. Något som resulterade i att han inte längre är bäste svensk på världsrankningen och att OS-platsen nu är i fara.
De andra svenskarna, Alex Norén och Henrik Norlander, var stabilare under torsdagens tävling, men bjöd inte på något storspel. Båda gick rundan på 71 slag och ligger på en delad 63:e plats, ett över par, inför den andra rundan.
Matt Jones från Australien, är i ensam ledning. Han tog sig runt de 18 hålen på 61 slag, nio under par.