29-åringen spelade hem Evian Championship i Évian-les-Bains i sydöstra Frankrike efter att ha gått den fjärde och sista rundan på tre slag under par och vunnit på totalt 14 under. Segermarginalen till tvåan och fjolårsvinnaren Brooke Henderson, Kanada, var sex slag.
Linn Grant blev bästa svenska på en delad 16:e-plats, elva slag bakom Boutier.
Tidigare har två franska damgolfare vunnit en major. Catherine Lacoste, som vann US Open 1967 som amatör, och Patricia Meunier-Lebouc som vann Chevron Championship, tidigare Nabisco Championship, i Kalifornien 2003.