När fem hål återstod låg nordirländaren på samma antal slag som Kurt Kitayama från USA. Då plockade McIlroy fram sina bästa svingar och levererade tre birdies efter varandra. Att han avslutade med två bogeys spelade mindre roll i sammanhanget.
Segersiffrorna för rundan skrevs till -4 under 67 slag, ett slag bättre än amerikanen.
Vinsten innebär att McIlroy, som slutade på -17 under 267, vunnit 23 gånger på PGA-touren och 31 gånger totalt.
Han kan nu också stoltsera med att ha nått toppen på världsrankingen nio gånger. På den punkten är det bara Tiger Woods och Greg Norman, med sina elva förstaplaceringar vardera, som klår honom.