Stenson gick på 63 slag, sju under par, och slutade trea.
Rasmus Højgaard, Danmark, gick också den sista ronden på 63 slag och vann ett slag före österrikaren Bernd Wiesberger som var ytterligare ett slag före Stenson som slutade på elva under par.
Svensken har haft ett tungt 2021, men hoppas kunna hitta formen på Europatouren och därmed konkurrera om en plats i Europalaget i Ryder Cup.
Stenson blev fyra i Tjeckien förra helgen och var nu ett snäpp bättre. Men hans tävling blev, likt alplandskapet i den schweiziska skidorten, upp och ned med 71–64–71–63.
Alexander Björk blev näst bäste svensk på delad 13:e plats, åtta under par.