Svenska innebandyförbundets styrelse har beslutat att inte förlänga kontraktet för Hill, som tillträdde i början av 2017.
Hill hann med en VM-turnering som förbundskapten, då Sverige förlorade finalen mot Finland 2018. Årets VM har skjutits upp på grund av coronapandemin.
Det är inte klart med någon ersättare till Hill, som redan nu kliver tillbaka även om kontraktet inte löper ut förrän i februari.
Mikael Hill har med framgång tidigare tränat klubbar som Jönköping och Mullsjö. Tränarkarriären inleddes i Vimmerby i mitten av 1990-talet.