Inför mötet ledde Colorado med 3–2 i matcher och det såg inledningsvis ut som att St Louis skulle lyckas med att få till en sjunde match i kvartsfinalserien.
1–0 till hemmalaget efter första perioden blev till 2–1 efter andra.
Men i tredje lade gästerna in en extra växel och efter kvittering plus det där avgörande målet i slutsekunderna fick så St Louis tacka för sig i årets Stanley Cup.
– Det är ett surt sätt att avsluta på. Men det är så det är. Våra killar kämpade hårt, säger St Louis-tränaren Craig Berube efter förlusten.
Colorado möter Edmonton i semifinalserien.
– De har spelat bra hockey, det är ett bra lag. Det blir en ny utmaning för oss och vi ser fram emot det, säger Colorados Josh Manson om det kommande motståndet.