SDHL-spelarna Agata Sarnovska, AIK, och Vendula Pribylova, Modo, gjorde varsitt mål bakom svenska målvakten Ida Boman, Djurgården.
Svenskorna hängde målmässigt med i en period sedan Djurgårdsforwarden och veteranen Fanny Rask kvitterat i sista sekunden av öppningsperioden.
Men nästa gång Damkronorna gjorde mål hade Tjeckien gjort fyra i rad – två i både andra och tredje perioden – och gått upp i 5–1-ledning.
Linnea Johansson, Linköping, fastställde 5–2 med drygt två minuter kvar.
Hilda Svensson, HV71, och Ebba Hedqvist, Modo, 16-åringarna som båda var med och tog silver i junior-VM i Östersund, debuterade i Damkronorna och Svensson fick pris som bästa svenska spelare.
Turneringen i Tyskland är den sista innan VM i Kanada i april och Sverige spelar fyra matcher på fyra dagar. På fredagen väntar Schweiz och därefter Tyskland (lördag) och Finland (söndag).