Halfvarsson var tvåa inför den avslutande etappen, runt en minut bakom Johannes Høsflot Klæbo. Svensken hade tolv sekunder till godo på Pål Golberg och ytterligare 13 sekunder ner till fyran Federico Pellegrino.
Därmed hade 33-åringen, som blev trea i Tour de Ski 2015, ett fint utgångsläge.
Men klättringen på nästan 500 meter upp för slalombacken har grusat skidåkares drömmar tidigare – och så även Halfvarssons om en ny pallplats i Tour de Ski. 33-åringen var rejält stum i backen och fick se åkare efter åkare passera.
– Det är tufft. Jag går för pallen men jag orkar inte i den här backen, säger Halfvarsson i den mixade zonen.
Trippelt norskt
En utpumpad Halfvarsson tog sig över mållinjen som 22:a på etappen.
– Backen är ändå en kul grej med touren och en rolig avslutning. Men för min del är det inte så bra, säger Halfvarsson.
I stället blev det trippelt norskt i totalen. Johannes Høsflot Klæbo, som inför loppet hade vunnit samtliga sex etapper, var inte först över mållinjen men han tog hem Tour de Ski för tredje gången i karriären.
Simen Hegstad Krüger, som vann etappen, blev tvåa i sammandraget, 59 sekunder bakom Klæbo. Hans Christer Holund fullbordade den helnorska pallen.
Halfvarsson blev till slut sexa i sammandraget, 48 sekunder från pallen.
TT: Hur mycket svider det att missa pallen?
– Det gör det alltid när man är högt uppe och slåss om pallplatser. Jag tappar mycket i dag, jag tappar allt, säger Halfvarsson.
I det stora hela var han dock nöjd.
– En helt okej tour i övrigt. Trög start och väldigt trögt i dag, men de övriga etapperna har varit helt okej.
"Värsta man kan göra"
William Poromaa var bäste svensk för dagen med sin tolfteplats och slutade på 24:e plats i sammandraget med Eric Rosjö precis bakom sig.
– Det är nog det värsta man kan göra. Det är bara uppåt och man blir helt stum i kroppen. Det blir också mycket med huvudet. Det är brutalt men också lite roligt och charmigt, säger Poromaa.
Johan Häggström blev 43:a och Oskar Svensson 45:a.