Pärmäkoski kommer därmed att stå över de två sista etapperna. Enligt finländska skidförbundet rör det sig inte om covid-19.
Pärmäkoski låg på tredje plats i totalställningen, en minut och fem sekunder bakom Frida Karlsson.
Finländskan är den andra av Frida Karlssons främsta konkurrenter som avbryter touren. Efter onsdagens jaktstart i Oberstdorf testades norskan Anne Kjersti Kalvå, då trea i sammandraget, positivt för covid-19.
En annan som avbryter Tour de Ski med två etapper kvar är Anton Persson, meddelar Svenska skidförbundet.
"Antons plan var att fullfölja touren men har i samråd med tränare och medicinska teamet valt att avbryta då han känner sig sliten", säger herrlandslagstränaren Anders Högberg i ett uttalande.