Louise Etzner Jakobsson och hästen Goldstrike B.J. gick ut som sjunde ekipage och klev upp på andra plats bakom Rodolpho Riskalla från Brasilien, men Etzner Jakobsson passerades sedan av både nederländskan Sanne Voets och belgiskan Manon Claeys.
Svenskan fick 72,634 procent, en bit efter segraren Voets som landade på 76,585 procent.
Närmare var det till Manon på bronsplatsen.
– Jag hade räknat att vi skulle vara bland de åtta bästa, så att jag skulle vara två tiondelar från bronset, det hade jag aldrig trott, säger hon.
"Ser inte problem"
Resultatet innebär att 61-åriga Etzner Jakobsson är kvalificerad till küren, det fria programmet, som avgörs på måndag.
– Det är fantastiskt. Jag kommer till final (i kür) och kan veta att “hallå, jag är ju bland de bästa”, säger hon.
Veteranen har haft allt annat än en optimal uppladdning inför spelen i Tokyo – för bara sju veckor sedan bröt hon benet och fick reda på att det krävdes operation.
– Då tittade jag i min almanacka med en gång och räknade veckor och dagar. Jag vet ungefär hur lång tid det tar för skelett att läka och att jag då skulle klara mig. Redan där är jag inne i att planera och se till att det här ska vi lösa, säger hon.
– Jag ser inte problem och hinder. Problem och hinder ska övervinnas.
"Så himla härligt"
Dessutom pensionerades hennes häst Zenard i fjol. Etzner Jakobsson har bara tävlat tillsammans Goldstrike B.J i knappt ett år. Det här var hästens tredje internationella tävling.
– Han var med mig helt och hållet och det är det som känns så himla härligt. Att efter så kort tid tillsammans ha det samspelet, säger hon.
Etzner Jakobsson tog dubbla brons tillsammans med Zenard i Paralympics i Rio de Janeiro 2016, i kür och individuellt.